基础医学系创办于1988年。基础医学第五轮学科评估为C+学科，入选湖南省“十四五”重点学科。拥有“模式动物与干细胞生物学”湖南省重点实验室、“生殖与转化医学”湖南省工程研究中心、“人体形态学展览馆”湖南省科普教学基地以及“肿瘤干细胞与转化医学”校级重点实验室。

基础医学拥有基础医学一级学科博士学位和硕士学位授权点。现设有人体解剖学、组织学与胚胎学、生理学、生物学、病理学五个教研室。面向本科生和研究生开设有系统解剖学、局部解剖学、应用解剖学、组织学与胚胎学、免疫组织化学、现代组织学、生理学、人体解剖生理学、高级生理学、细胞培养技术、细胞生物学、 医学遗传学、病理学、病理生理学、高级病理学、高级病理生理学16门涵盖各专业的医学基础课程，《组织胚胎学》为国家一流本科课程，《生理学》为省级精品课程。

现有专职教师35人，其中教授8人，副教授10人。多位教师获湖南省青年教师课堂教学竞赛一等奖及教学能手。近年来，获得国家自然科学基金项目等各级各类科研项目100余项，主编和参编各类教材20余部，发表SCI等科研论文和教改论文230余篇，获湖南省自然科学奖二、三等奖各1项，获国家发明专利授权10余项。2022年荣获“湖南省工人先锋号”称号。

系主任：罗怀青

系副主任：申 丽

1．病理生理学教研室

室主任：邓 虹

成 员：邓锡云  付淑君  郭晓伟  谷 峰  王忆安

2．病理学教研室

室主任：厉 浩

成 员： 余 星  杨剑锋  谢平平  肖 恒  王小莉

3．组织学与胚胎学教研室

室主任：孙国瑛

成 员： 谭三勤  田 玫

4．人体解剖教研室

室主任：简晓红

成 员： 邓春雷  刘向光  聂团文  周建林  周利红  丁思余

5．生物教研室

室主任：杨粤军

成 员： 蒋逸群  易 琦  任凯群

6．生理教研室

室主任：李 翔

成 员： 何祖平  申 丽  张坚松  罗怀青  饶周舟  欧阳新平